مدرسه علمیه حضرت فاطمه (س) با هدف تحکیم و ترویج فرهنگ اسلامی و شیعی و حمایت از ارزش های اسلام و انقلاب در سال 1360 تاسیس گردید. پشتیبانی از جنگ و جبهه های نور علیه ظلمت، تشکیل کلاسهای قرآن، عربی و اخلاق و فعالیت های هنری عمده ترین فعالیت ها را با توجه به شرایط خاص آن مقطع انقلاب به خود اختصاص می داد. فعالیت های این مدرسه به مروز توسعه یافته تا اینکه در سال 75 با نظارت مستقیم مرکز مدیری حوزه های علمیه (قم) اقدام به تشکیل کلاس های حوزوی گردید و کلیه امور ساماندهی و نظارت علمی و آموزشی آن مرکز ادامه یافت.

استقبال جوانان شیفته زلال معرفت الهی از همان مقطع بسیار بوده و هم اکنون بیش از 300 طلبه خواهر در پایه های اول تا پنجم به صورت رسمی و غیر رسمی مشغول به تحصیل می باشند.

مخارج مدرسه عمیه از بدو تاسیس تاکنون توسط عده ای از محبین و دوستداران مکتب اهل بیت سلام الله علیهم تامین می گردد. همچنین جا دارد از زحمات و خدمات واقف و موسس این حوزه مرحوم حاج عباسعلی محرر خوانساری یاد شود. ایشان از مومنین انقلابی بودند که منزل خود را برای تاسیس این مدرسه ی علمیه وقف کردند.

مدرسه حضرت فاطمه سلام الله علیها در دو سطح دو و سه ی حوزه به آموزش خواهران طلاب می پردازد.